题主您好，碱基对之间的氢键键能有相同的，也有不相同的。
腺嘌呤与胸腺嘧啶之间的氢键有两个，其中一个以N—H相连，形成分子间相互作用，另一个以O-H相连，形成分子间相互作用。胞嘧啶与鸟嘌呤直接有三个氢键，其中两个是N-H相连，一个为O-H相连。而我们都知道，水分子的氢键有两个O-H相连的，虽然F,O,N,都能与H形成分子间相互作用（即，氢键）但它们并不完全相同的，这与原子的电负性大小有关，所以各自键能不同。所以综上，碱基对之间的氢键和水分子之间的氢键键能有的相同有的是不同的。
望采纳，谢谢。
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