你的系统重新装过或者用镜像还原过以后，就可以直接手动删除了，因为在你还未运行此软件之前，此时注册表是干净的，跟这个软件没有任何关联，所以手动删除是安全的，不会对注册表产生什么损害。
这就相当于要改造电路，换新变压器（相当于软件），如你所说你覆盖了C盘，就相当于切断了旧变压器扯出来的电线，所以你可以安全的扔掉旧变压器，当然我举的例子可能不太恰当。
直接删除
把那个软件的文件夹直接删掉就行了
鼠标右击那个软件的执行文件，属性里可以查到该软件所在文件夹，删除那个文件夹就OK了
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